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吃屎可以减肥这些微生物基因测序公司
你以为你每天克制饮食,勤于锻炼,就一定会瘦吗?
实验证明,与其刻苦减肥,不如“吃屎”。
年,美国微生物科学院院士、上海交大教授赵立平通过微生物基因组测序技术,证实肥胖与双歧杆菌减少、硫酸盐还原菌增加正相关。为了改变胖子的肠道菌群,医院研发了一种“有味道”的技术:把瘦子的粪便制成减肥药。这项技术称为“粪菌移植”,已经成为微生物组产业三大支柱之一(微生物基因组检测、微生态药物以及粪菌移植技术)。
听起来有些难以下咽,但学界认可:目前粪菌移植技术在SCI上已有篇相关文献发表。
我们的肠道里有上千种微生物、万亿个微生物细胞。如何知道哪一种微生物能够帮助减肥?哪些微生物会让人变胖?
肠道中有双歧杆菌、大肠杆菌、优杆菌、类杆菌等上千种微生物。
这就需要用到微生物基因组测序和分析。简而言之,就是对微生物进行基因测序,然后放到数据库中进行比对,继而分析出微生物的种类,哪一种有益,哪一种有害,甚至各自的功能。
年5月,奥巴马政府推出“国家微生物组计划(NMI)”,启动资金超过5亿美元。国际上已有8个人体微生物组计划,9个环境微生物组计划。人类投资数十亿美元,试图用基因测序精准描绘十几万种微生物的遗传信息。
为什么微生物的基因会受到如此重视?
目前人体与动物基因组已测序完毕,数据库完备。而微生物基因组测序比前两者整整晚了十年。
微生物组测序这片未知领地一经探索,可推动以下三个领域的发展:
1、微生物可以应用于临床诊断和治疗
例如,如果我们想要避免做肠镜,可以以粪便为样本,检测肠道菌群,找出失调的微生物,与已知的病症对应菌群分布进行对比,诊断病情。进而研发出相应药物对失调的微生物进行激活或者抑制。
人体自身携带万亿个微生物细胞,总重量加起来超过1公斤。微生物与人体互利共生,互相影响健康。科研已证实肠道菌群失调与肥胖症、糖尿病、精神疾病等等有直接关系。
2、微生物可以应用于保健品行业
比如某些酸奶就主打益生菌和益生元对肠道的益处。不同菌种、不同菌株和配比,能产生不同功效,可根据每种人群的肠道菌群,针对性研制益生菌产品,还可用肠道菌群测序结果来评价保健品的调理效果。
3、微生物可应用于农业
微生物养料可精确定制不同农作物所需的微生物养料,可显著提高农业产量。
图为非洲最大的棉花基地BurkinaFaso,主席ChristianKabore在采访中表示,棉花产量已经不足了。
年,生命科学家弗雷彻曼(Fleichman)完成了流感嗜血杆菌的全基因组测定,微生物基因测序的研究启动。年,微生物基因测序已做好广泛应用的准备。为什么这么说呢?
第一,基因测序技术经历了三代革新,第三代测序技术时间缩短、成本降低,让大规模微生物组测序成为可能。对于一个微生物的全基因组,第一代测序技术要台仪器、数年、数十万美元才能测完。而现在一台仪器、十分钟、几千美元就能测。
第二,微生物基因的数据库越来越大、越来越精准。
年,美国启动了个微生物组测序的“人类微生物组计划”,目前已接近完成。截止年,在美国国家生物技术信息中心(NCBI)的公开数据库,已收录种细菌、种病毒、种古生菌的全基因组序列。
第三,云计算、机器学习在生物方面的应用开始普及。
微生物组信息量极大。如果把NCBI的微生物组数据用DVD储存(平均MB),这些DVD垒起来有4个世界第一高楼迪拜塔高。云计算的出现,能够突破本地储存对硬件的高要求。
微生物基因的数据信息复杂。即使最新测序技术也无法突破测序结果误差大,不完整的瓶颈。这些碎片化,有错误的的微生物信息难以正确比对数据库中的信息。而机器学习算法发展,能够有效,快速得分析数据。
在欧美,“微生物组测试”正在从实验室走向市场
在中国,微生物组测序服务只针对科研,提供者如华大基因、诺禾致源、美吉生物等。目前,微生物组测序的商业应用一片空白,人们正期待新的产业诞生。
目前,将微生物组测序进行商业应用的公司大部分处于初创阶段,主要集中在法国和美国两个国家。应用于医疗诊断,农业和保健食品三个领域。深蓝挑选出了三家相对成熟的创业公司,挑选依据如下:对应市场需求点、技术可靠程度、创始人背景。
1、EnteromeBiosicence
创始团队通过研究肠道菌群基因组开发药品,有望根治号称消化科“头号怪病”的克罗恩病。这是一种病因不明、反复发作、无法根治的肠道炎症性疾病。团队发现,形成该病的主要原因是粘附侵袭性大肠杆菌(AIEC)过多,造成肠道黏膜病变。这款能有效抑制大肠杆菌增殖的药物正处于人体临床试验阶段。
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