锐帮读前瞻性病例对照研究极早产婴儿

Gutbacteriadysbiosisandnecrotisingenterocolitisinverylowbirthweightinfants:aprospectivecase-controlstudyTheLancet，.03，IF=45.通讯作者：1)ProfWilliamDShannonPhD,Email:wshannon

dom.wustl.edu,DepartmentofMedicine,WashingtonUniversityinStLouisSchoolofMedicine,StLouis,MO,USA2)ProfPhillipITarrMD,tarr

wustl.edu,DepartmentofPediatrics,WashingtonUniversityinStLouisSchoolofMedicine,StLouis,MO,USA坏死性小肠结肠炎对产重极低的幼儿的小肠具有灾难性的损伤，然而近三十年它的发病率、死亡率、治疗方法等并没有得到明显的改善。坏死性小肠结肠炎在子宫中并不发生，抗生素的使用能够增加患病的可能性，而母乳和益生菌的使用能够降低发病的机率。这些现象表明坏死性小肠结肠炎与肠道微生物具有紧密的联系。该研究利用Roche测序平台对那些后期患坏死性小肠结肠炎的儿童和健康儿童的粪便样品进行16SrDNA测序，评估这些婴幼儿粪便中的细菌微生物群落结构是否有差异。材料与方法以StLouis,OklahomaCity及Louisvillecohorts医院的儿童作为受试者。收集所有婴幼儿的粪便并保存直至确认哪些幼儿会患坏死性小肠结肠炎。测序平台：Roche(GSFLXTitaniumSystem)16SrDNA(V3-V5区)研究结果研究共收集了个婴儿的粪便样品（医院分别为、、个婴儿），最后确认58个婴儿（6%）患坏死性小肠结肠炎，其中21（36%）死亡。1、门水平上物种丰富度比较在门水平上，患坏死性小肠结肠炎和正常婴儿的肠道里主要分布着Bacilli、Gammaproteobacteria、Clostridia以及Negativicutes（图1）。图1门水平上物种丰度比较2、除了Clostridia外，每一个纲包含同样的属或者科（图2），其中Gammaproteobacteria门中Enterobacteriaceae、Escherichia或Shigella、Klebsiella占主要优势，Negativicutes门中Veillonella、Negativicoccus、Megasphaera占主要优势。图2Gammaproteobacteria和Negativicutes门在属或科水平上丰度比较3、研究发现正常幼儿粪便中细菌多样性指数明显的增加而患坏死性小肠结肠炎粪便中变化不明显。图3StLouiscohort医院婴儿粪便微生物每15天的Shannondiversity分析结论1)研究发现后期患坏死性小肠结肠炎的粪便微生物群落结构与那些健康的婴幼儿相比，具有显著性的差异，这些不同在出生后30天之内就开始产生。2)坏死性小肠结肠炎的发生与Gammaproteobacteria的丰度呈正相关，而与那些严格厌氧细菌（特别是Negativicutes）的丰度呈负相关。亮点1)首次对后期患坏死性小肠结肠炎和健康的极早产婴儿的肠道微生物菌群种类差异进行评估；2)对坏死性小肠结肠炎的临床研究进行了数量非常大的病人病例和样品收集；3)此研究进一步支持了坏死性小肠结肠炎与肠道细菌多样性缺失相关的观点。4)此研究证明未来细菌含量和患坏死性小肠结肠炎的风险模型可以通过γ变形菌门和厌氧细菌的数量变化来解决。锐翌基因服务锐翌基因采用IlluminaHiSeqPE测序策略对16SrDNA的V3+V4或多种单可变区进行测序，数据质量更高（Q30≥90%），而且测序通量显著提高；更有经验丰富的数据分析团队，完善的技术支持与服务；再加全面升级的分析内容，和高大上的网页版结题报告，给各位新老客户完美的测序体验。供稿：赵永田编辑：黄蓉







































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