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Science解密肠道菌到底是从哪里来的
科研人员在7月22日的Science上刊登的文章发现：肠道菌从人类和非洲猿的共同祖先那传下来已经至少万年了。当猿分裂成不同的物种，他们内部的微生物也一样。肠道菌之间的种属关系反映了大猩猩、黑猩猩、倭黑猩猩和人类的家族树。
人类并没有单独进化。这项新的研究表明数以万亿计的微生物伴随着我们从史前猿类开始的进化道路上不断发展。但研究也发现，我们已经失去了一些依然栖息在我们猿类近亲体内的古老微生物，这也许能解释人类一些疾病，包括肥胖和精神障碍。
猿类的分析解密肠道菌来源
人类和其它猿类尤其是在肠道，栖息着很多微生物。这些微生物来自何处？我们的远古祖先，还是我们的环境？之前一个收集了各种哺乳动物的粪便细菌的研究表明，相对于从环境中获得，微生物更可能是遗传性的。但其他研究发现，饮食在塑造我们的肠道中的细菌起着重要的作用。
为了解决这个秘密，AndrewMoeller转向研究野猿。作为他博士论文的一部分，它研究了来自坦桑尼亚的47只黑猩猩、刚果民主共和国的24只倭黑猩猩，喀麦隆的24只大猩猩和来自美国康涅狄格州的16个人的肠道菌粪便样本。他和Texas大学的同事比较了一个在猿类包括人的肠道微生物中很普遍的、快速进化的基因的DNA序列。然后他们将不同的DNA基因序列归类为家系树。
肠道菌来源于远古祖先
结果证明，大多数我们的肠道微生物已经伴随着我们进化了很长一段时间。Moeller发现人和猿类肠道微生物中三分之二的主要的家族可以追溯到万年前的共同祖先。当猿类的不同物种从这个共同祖先中分化出来，它们的肠道菌也分裂成新的株系，并平行地协同进化来适应不同的饮食、栖息地和宿主的肠胃道疾病。到了今天，这些微生物能够很好地适应并帮助训练我们的免疫系统，指导我们肠道的发展，甚至调节我们的情绪和行为。
这项研究还发现在猿类物种分化的过程中，有些也失去了在其它灵长类动物中一直都有的细菌菌株。这可能是另一种宿主适应的信号。
在最后一个实验中，研究者深入到人类的微生物菌群中。他们在美国康涅狄格州和非洲马拉维的人群的样本中，比较在猿类中已经分析过的相同DNA序列。他们发现这些来自非洲的细菌菌株在万年前从那些来自美国的分化出来，这与最早的人类祖先走出非洲的迁徙相对应。Moeller说这提示了肠道微生物可以被用来追溯早期的人类和动物的迁徙。
有意思的是，美国人缺乏一些在马拉维人以及大猩猩和黑猩猩中找到的一些细菌。这和在工业社会中的人中通常肠道微生物多样性下降相吻合，这可能是由于饮食的改变和抗生素的使用。
这项工作是了解人类微生物菌群进化史上的重要一步。它清楚的表明了肠道微生物在几百万年代际之间的纵向传递。
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