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锐帮读16S测序研究肠道菌群失调与强



Briefreport:IntestinaldysbiosisinankylosingspondylitisArthritisRheumatology强直性脊柱炎(AS)是以骶髂关节和脊柱附着点炎症为主要症状的疾病,其发病过程缓慢,检测困难。目前的研究表明,AS具有遗传特性并受环境影响显著。肠道与血清阴性脊柱关节病(spondyloarthropathies,SpA)关系密切;而实际病例观察中,关节炎患者也一般会患有肠道或生殖道的感染。AS作为一种典型的SpA,其发病机理与肠道微生物之间也必然会存在某种关系。然而还没有直接的研究表明他们之间的直接关系。本文对AS患者和健康人肠道菌群进行比较,观察其肠道菌群的差异。材料与方法取样:9个AS患者,9个健康对照,回肠末端样品测序:16SrRNA基因,V4区,MiSeqPE研究结果AS患者和健康人肠道微生物多样性具有很大差异性(图1A),并且AS患者肠道中微生物多样性更加丰富(图1C)。图1AS患者和健康人肠道菌群丰度差异分析A:门水平上微生物柱状图;B:肠道微生物WeightPCoA分析;C:α多样性差异;D:样品间和样品内部UniFrac距离分析对AS患者和健康人肠道菌群进行比较发现7个差异菌群,其中在AS患者中富集的是Lachnospiraceae(P=0.)、Veillonellaceae(P=0.01)、Prevotellaceae(P=0.)、Porphyromonadaceae(P=0.)和Bacteroidaceae(P=0.),在健康人中富集的是Ruminococcaceae和Rikenellaceae(图2A)。为进一步分析AS微生物的特性,对不同微生物之间进行相关性分析(图2B)发现,Lachnospiraceae与Ruminococcaceae之间呈正相关,Veilonella与Prevotella之呈负相关。图2AS与健康人标记菌群及相关性分析A:科水平上微生物差异;B:菌群件相关性分析对发现的微生物进行pathway富集分析发现在AS个健康人中存在一些先出差异的功能及菌群,如与丁苷菌素和新霉素相关的Bacteriodaceae及与次级胆汁酸相关的Clostridia和Ruminococcaceae微生物。同时对不同群体核心微生物(core)微生物进行分析发现,AS中的核心微生物就是其标记微生物,说明这些微生物在影响微生物组成中的重要作用。结论AS患者与健康人之间肠道菌群存在明显差异,并且微生物组成与疾病之间具有显著相关性。亮点

首次开展肠道微生物与AS之间相关性研究,发现了一些与疾病发生发展相关的一些微生物。实验设计思路简单,结果简单明了。虽然文章分析内容不是很多,但是都是围绕实验主题设计,对指导我们实验的分析具有一定借鉴意义。

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供稿:牛成镇编辑:黄蓉







































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