中国好声音丨肠道菌群特征对炎症性肠病诊断

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肠道菌群特征对炎症性肠病诊断和药物应答的预测作用

文献来源：mSystems.Jan30;3(1).pii:e-17

既往的观点和实践

在传统的概念里，IBD被认为是一种西方疾病。随着经济和生活水平的发展，亚洲人群IBD的发病率不断增加，日益成为全球性的医疗卫生问题。

虽然IBD的确切病因仍然难以确定，但众所周知，遗传背景、肠道微生物和环境因素都与IBD相关。但与IBD相关的遗传多态性研究表明，肠道微生物失衡导致的异常免疫反应，可能是潜在的IBD发病关键机制之一。

人类肠道菌群与免疫系统频繁地相互作用，在IBD发病的过程中扮演着重要角色。全基因组关联研究（GWAS）已经鉴定出超过个与IBD相关的单核苷酸多态性（SNPs）位点，其中许多涉及调节宿主对微生物刺激的反应途径。

NOD2基因是第一个被鉴定与IBD易感性相关基因，可识别细菌细胞膜的成分。此外有研究显示，拟杆菌可分泌荚膜多糖A，可诱导调节性T细胞表达白细胞介素-10，最终影响结肠炎的发生和发展。

面临的问题

之前有研究显示，在肠道菌群的层面，IBD患者与健康个体存在广泛的差异。IBD患者肠道整体生物多样性减少，某些特定细菌（如厚壁菌门的几个亚群）的丰度降低，而一些菌种（γ-变形菌）的丰度增加。

不同国家和地区人群的饮食习惯、生活方式和肠道菌群存在差异。但目前还不清楚这种肠道菌群的差异，是否独立影响IBD等疾病的发生，是否存在可用于IBD诊断和预后评估的微生物标志物。

关于菌群状态与肠道炎症的关系，之前绝大部分研究是在北美、欧洲和日本人群中进行的，其遗传学、种族背景、生活环境、饮食习惯和生活方式与中国不同。目前只有少数研究报道了中国IBD患者肠道微生物多样性的特征，描述微生物组成和IBD疾病表型之间的相关性。

在治疗CD或UC方面，英夫利西单抗（IFX）是一种有效的治疗药物，但目前有很多临床问题需要回答：为什么部分患者对IFX没有应答，哪类患者受益最多，何时可以停止治疗，停药复发再次使用是否仍然有效。

肠道菌群的特征和状态，是否可以预测药物的疗效，从而指导并优化临床决策，最终改善患者的治疗结局。这是一个吸引人的话题，具有重要的临床意义。

这项研究有什么新发现

这项研究医院陈烨教授团队，选取了不同疾病活动状态的中国IBD患者，分析其肠道微生物组的组成和特征，评估不同IBD患者人群的肠道菌群差异。试图寻找潜在的菌群生物标志物，用于反映和预测IBD的疾病进展和IFX的治疗应答。

此外，研究通过分析中国IBD患者的粪便微生物特征，并与两个西方IBD队列（PRISM和RISK）进行荟萃分析，发现中国IBD患者的肠道微生物特征，与西方IBD患者相似。

基于肠道微生物特征而构建的IBD诊断预测模型，对于克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）的预测准确率分别为87.5%和79.1%。

相关分析结果显示，放线菌Actinobacteria和变形菌Proteobacteria丰度的增加，厚壁菌Clostridiales丰度的降低，与IBD严重程度存在显著相关性（P0.05）。

使用英夫利西单抗（IFX）治疗持续应答的患者，呈现出肠道菌群多样性的快速恢复，尤其是梭状芽胞杆菌Clostridiales的相对丰度的显着增加。

某些微生物（主要是梭状芽孢杆菌）单独预测IFX有效的准确率为86.5%。结合钙卫蛋白水平和克罗恩病活性指数（CDAI），对IFX疗效预测的准确率能达到93.8%。

因此，肠道菌群特征可作为潜在的通用生物标志物，用于IBD诊断、疾病活动度评估和英夫利西单抗的疗效预测。

启示和影响

这项研究显示，粪便肠道菌群可能会成为潜在的通用生物标志物，用于无创评估IBD严重程度和IFX治疗效果。通过肠道菌群特征对IBD患者进行分层，进行个体化的治疗和管理，可能是未来的一个新的思路。

这项研究再一次证明，IBD患者肠道菌群的多样性低于健康个体，但菌群多样性降低的程度在CD和UC患者之间无显著差异。无论是中国人还是西方人都是如此。

在新发CD（治疗开始前）患者中，肠道菌群多样性的变化与疾病状态存在强烈的相关性。这至少从概念上证明了使用肠道菌群特征辅助IBD诊断和疾病管理的潜力。

关于IBD的治疗的预测，目前主要基于临床预测因素来进行判断，例如粪便钙卫蛋白可用于预测IBD患者的复发，C反应蛋白（CRP）水平可预测生物制剂诱导和维持缓解的水平。

最近，肠道菌群特征作为IBD生物标志物的价值备受

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