科研中国人肠道菌群及其与主食类型种

肠道微生物群可能影响人类健康和疾病。尽管在中国人群中已经广泛研究了与疾病相关的微生物群落改变，但仍然缺乏一个全国性的中国肠道微生物群基线。

在这里，我们对来自名健康中国个体的粪便样本进行了16SrRNA基因测序，这些个体属于八个民族群体，并居住在28个省份的63个县/市。我们鉴定了四种肠道类型，其中三种分别富含普雷沃特氏菌、拟杆菌和大肠杆菌，而第四种没有优势属。通过评估肠道微生物群与地理、人口统计学、饮食、城市化、生活方式和采样月份等六个类别的20个变量之间的关联，我们揭示了地理因素解释了最大的微生物群变异，并阐明了与主食类型、民族和城乡居住的关联模式的差异。

具体来说，来自同一地点的汉族和少数民族群体的肠道微生物群比来自不同地点的同一少数民族群体的肠道微生物群更相似。基于功能预测，以小麦为主食的个体被预测拥有更多涉及葡聚糖1,3-β-葡萄糖苷酶和S-腺苷甲硫氨酸生物合成的微生物基因，而不是以大米为主食的个体。此外，观察到城市化对降低个体间多样性、增加个体间多样性和增加拟杆菌类型的比重有显著影响。总体而言，我们的研究提供了中国人群的全国性肠道微生物群基线和有关重要协变量的知识，这对于转化微生物群研究至关重要。

人类肠道拥有一个特殊的多样化微生物生态系统，据估计有-种细菌物种居住在我们的肠道中。肠道微生物群通过形成对抗病原体的屏障、产生生物活性代谢产物和调节免疫功能，为我们的健康提供了巨大的益处。肠道生态系统的稳态由一些核心物种维持，这些物种通常在不同个体之间共享，而在没有强烈影响因素（例如饮食变化或抗生素治疗）的情况下，健康成年人的肠道微生物群相对稳定。

肠道微生物群的失衡（即菌群失调）与许多疾病相关，例如炎症性肠病、肥胖症、过敏和自身免疫疾病。通过广泛的疾病靶向微生物群研究，已经揭示了许多微生物组分涉及一系列病理学，并且理论上可以作为生物标志物。例如，粪便微生物标志物用于筛选结直肠癌已经被广泛研究。然而，将微生物群研究转化为临床实践仍然受到多重挑战的限制，特别是精确分类“健康”微生物群的困难，这需要全面了解健康人群的微生物群变异和协变量。一项基于中国一个省份的14个地理区域的名个体的研究表明，在一个地方开发的基于微生物群的代谢疾病模型不能推广到其他地方，并且随着地理范围的增加，插值模型的效率降低。这强调了地理因素对肠道微生物群组成和疾病模型应用的影响，而中国更大地理范围内的微生物群变异尚未被探索。

除了地理因素，许多肠道微生物群协变量已经被揭示，包括饮食、生活方式、种族、社会经济地位、药物和遗传。例如，肠道微生物群的分层（称为肠道类型）已经与饮食，特别是纤维和碳水化合物的摄入有关；城市化已经与个体间变异的增加和具有高纤维降解潜力的物种的丧失有关；在种族间差异性丰富的类群被认为与慢性疾病有关。到目前为止，大多数研究肠道微生物群协变量的人口水平研究都集中在西方人群（欧洲和美国）以及以色列、日本和中国的少数研究，而在非洲、南美和亚洲其他地区的研究很少。

中国有各种食物风格，生活在不同地区的人在饮食上表现出很大的多样性。此外，中国有56个民族，这些民族在饮食、生活方式、习俗和文化方面具有独特的特点。因此，预计中国人群中的肠道微生物群会多样化。同时，由于城市化的速度和规模前所未有，中国人的生活方式正在迅速变化，饮食习惯正在向西式饮食转变。具体来说，消费更多的高脂肪和高蛋白食品，而摄入的谷物较少，这可能会显著改变肠道微生物群，就像在其他发展中国家观察到的那样。尽管已经进行了一些研究来调查中国肠道微生物群的特征，但这些研究要么

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